Genetic evidence for a recent divergence and subsequent gene flow between Spanish and Eastern imperial eagles

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Dating of population divergence is critical in understanding speciation and in evaluating the evolutionary significance of genetic lineages, upon which identification of conservation and management units should be based. In this study we used a multilocus approach and the Isolation-Migration model based on coalescence theory to estimate the time of divergence of the Spanish and Eastern imperial eagle sister species. This model enables estimation of population sizes at split, and inference of gene flow after divergence.</p> <p>Results</p> <p>Our results indicate that divergence may have occurred during the Holocene or the late Pleistocene, much more recently than previously suspected. They also suggest a large population reduction at split, with an estimated effective population size several times smaller for the western population than for the eastern population. Asymmetrical gene flow after divergence, from the Eastern imperial eagle to the Spanish imperial eagle, was detected for the nuclear genome but not the mitochondrial genome. Male-mediated gene flow after divergence may explain this result, and the previously reported lower mitochondrial diversity but similar nuclear diversity in Spanish imperial eagles compared to the Eastern species.</p> <p>Conclusion</p> <p>Spanish and Eastern imperial eagles split from a common ancestor much more recently than previously thought, and asymmetrical gene flow occurred after divergence. Revision of the phylogenetic proximity of both species is warranted, with implications for conservation.</p

Genome-Wide and Paternal Diversity Reveal a Recent Origin of Human Populations in North Africa.

The geostrategic location of North Africa as a crossroad between three continents and as a stepping-stone outside Africa has evoked anthropological and genetic interest in this region. Numerous studies have described the genetic landscape of the human population in North Africa employing paternal, maternal, and biparental molecular markers. However, information from these markers which have different inheritance patterns has been mostly assessed independently, resulting in an incomplete description of the region. In this study, we analyze uniparental and genome-wide markers examining similarities or contrasts in the results and consequently provide a comprehensive description of the evolutionary history of North Africa populations. Our results show that both males and females in North Africa underwent a similar admixture history with slight differences in the proportions of admixture components. Consequently, genome-wide diversity show similar patterns with admixture tests suggesting North Africans are a mixture of ancestral populations related to current Africans and Eurasians with more affinity towards the out-of-Africa populations than to sub-Saharan Africans. We estimate from the paternal lineages that most North Africans emerged ~15,000 years ago during the last glacial warming and that population splits started after the desiccation of the Sahara. Although most North Africans share a common admixture history, the Tunisian Berbers show long periods of genetic isolation and appear to have diverged from surrounding populations without subsequent mixture. On the other hand, continuous gene flow from the Middle East made Egyptians genetically closer to Eurasians than to other North Africans. We show that genetic diversity of today's North Africans mostly captures patterns from migrations post Last Glacial Maximum and therefore may be insufficient to inform on the initial population of the region during the Middle Paleolithic period.This study was supported in parts by Spanish Government MCINN grant CGL2010-14944/BOS and Programa de Cooperación Interuniversitaria e Investigación Científica, Spanish Ministry of Foreign Affairs and Cooperation grants A75180/06, A/8394/07, B/018514/08, A1/040218/11.Peer Reviewe

Autopistas salvajes: propuesta de WWF España para una Red Estratégica de Corredores Ecológicos entre espacios Red Natura 2000

La propuesta de corredores realizada en este documento se basa en los resultados del siguiente estudio encargado por WWF España: Estudio para la identificación de redes de conectividad entre espacios forestales de la Red Natura 2000 en España. ETSI Montes, Forestal y del Medio Natural. Universidad Politécnica de Madrid. 2016. Autores: María Cruz Mateo Sánchez, Begoña de la Fuente Martín, Aitor Gastón González y Santiago Saura Martínez de Toda.[ES] Un territorio donde los espacios de valor natural estén conectados y se permita el movimiento de fauna y flora, el intercambio de genes y, en un sentido más amplio, el funcionamiento de procesos ecológicos, es clave para conservar la biodiversidad y los recursos naturales y para afrontar con mayores garantías los efectos indeseables del cambio climático. En España, además, sometida a fuertes procesos de transformación del paisaje y a los efectos del cambio climático, el freno a los procesos de aislamiento y fragmentación de hábitats para las especies y la búsqueda de soluciones para garantizar la conectividad ecológica se convierten en tareas especialmente relevantes para detener la pérdida de biodiversidad. Y es que diversos estudios ya han constatado que no es posible alcanzar los objetivos de conservación basándose únicamente en la declaración de espacios protegidos aislados (Franklin, 1993; Krosby y otros, 2010; Laurance y otros, 2012; Juffe-Bignoli y otros, 2014; Saura y otros, 2018). Esto ha tenido como consecuencia que comience a considerarse, en un número creciente de países, la necesidad de establecer redes de conectividad que faciliten el flujo de organismos y procesos ecológicos entre dichos espacios. A la vista de esto, y de las obligaciones legales derivadas de las legislaciones europea y nacional, WWF presenta en este documento una visión de conectividad para la España peninsular con una propuesta de corredores ecológicos como nexos entre espacios de la Red Natura 2000. Es una identificación que tiene en cuenta los corredores transfronterizos, que funcionan como conectores entre espacios ubicados en territorio español y trascurren en parte de su trazado por territorio de países limítrofes (Portugal, Francia y Andorra). Por motivos metodológicos no se incluyen en el estudio los territorios insulares. Esta propuesta ha sido generada a partir de un estudio realizado por la Universidad Politécnica de Madrid por encargo de WWF España. Se han identificado los corredores prioritarios entre los hábitats forestales de Red Natura 2000 con el objetivo de garantizar la movilidad de las especies forestales. Se ha elegido este enfoque por la amplia representación de este tipo de hábitats en España y en la Red Natura 2000, así como por la mayor disponibilidad de información necesaria para los análisis de conectividad. También se ha determinado qué corredores tienen mayor necesidad de ser restaurados para mejorar la conectividad de la red, cuáles son prioritarios para la conservación, de manera que se mantengan al menos en sus condiciones actuales, y qué tramos de estos corredores están actuando como cuellos de botella, dificultando el movimiento de las especies y con condiciones particularmente frágiles para garantizar su papel conector. Esta propuesta se ha realizado usando las mejores y más recientes herramientas y metodologías disponibles para el análisis de la conectividad (Saura y Pascual-Hortal, 2007; Saura y Torné, 2009; McRae y Kavanagh, 2011; De la Fuente y otros, 2018) y se centra en las necesidades de movimiento de un amplio grupo de especies forestales y en favorecer la conexión para una variedad de hábitat (bosques densos, bosques claros y matorrales) y procesos ecológicos asociados a los mismos. Sin embargo, la propuesta no abarca aspectos como la conectividad para especies y hábitats de tipo más estepario y de ámbito agrario, así como la de hábitats acuáticos. Sin duda, sería de gran interés analizar dichas carencias en el futuro para sumar información al presente estudio. En conclusión, los resultados aportan información geográfica explícita clave para ser tenida en cuenta por políticas ambientales y sectoriales —de planificación territorial, agricultura o transporte— y alcanzar así las obligaciones y compromisos de España respecto a la conservación de la biodiversidad. Autopistas Salvajes. Propuesta de WWF España para una Red Estratégica de Corredores Ecológicos entre espacios Red Natura 2000 aporta una visión necesaria y de futuro que también será muy valiosa para alcanzar la conectividad ecológica entre países europeos.Este trabajo ha sido posible gracias al apoyo de la Fundación MAVA

Multiplex single-nucleotide polymorphism typing of the human Y chromosome using TaqMan probes

Grupo de trabajo: The Genographic Consortium.[Background] The analysis of human Y-chromosome variation in the context of population genetics and forensics requires the genotyping of dozens to hundreds of selected single-nucleotide polymorphisms (SNPs). In the present study, we developed a 121-plex (121 SNPs in a single array) TaqMan array capable of distinguishing most haplogroups and subhaplogroups on the Y-chromosome human phylogeny in Europe.[Results] We present data from 264 samples from several European areas and ethnic groups. The array developed in this study shows >99% accuracy of assignation to the Y human phylogeny (with an average call rate of genotypes >96%).[Conclusions] We have created and evaluated a robust and accurate Y-chromosome multiplex which minimises the possible errors due to mixup when typing the same sample in several independent reactions.Peer reviewe

Association of occupational physical activity and disability pension in 756,159 Spanish workers: A prospective cohort study with 13 years follow-up

Recent research from Nordic countries identified occupational physical activity (OPA) as a risk factor for disability pension, but further research accounting for exhaustive analyses in novel populations is warranted. Our objective was to assess the association between OPA and disability pension using administrative data. This prospective registry-based cohort study used data from the Spanish Continuous Working Life Sample (CWLS). Participants were followed up from baseline (January 1, 2006) to first event of disability pension, mortality, or end of follow-up (September 1, 2019). The assessment of OPA was based on registers of economic activity and their correspondence with a validated OPA index. To examine the association between OPA and disability pension, adjusted proportional hazard, and Fine-Gray models using mortality as competing risk were conducted. We retrieved data from 756,159 workers (57.7% men) with an average age of 38.5 years (SD 11.9). During 13.6 years from baseline to the end of follow-up (9,463,041 person-years), 18,191 men (4.2%) and 9631 (3.0%) women received a disability pension. In the fully adjusted model, participants exposed to higher levels of OPA showed higher risk for disability pension in an exposure-response fashion. Men and women exposed to very high OPA showed the highest HR for disability pension (2.31 [95% CI, 2.17 to 2.46] and 1.68 [95% CI, 1.56 to 1.81], respectively. These results warrant preventative measures to address early involuntary exit from the labour market in workers exposed to high physical work demand

Impact of Recommended Maternal Vaccination Programs on the Clinical Presentation of SARS-CoV-2 Infection: A Prospective Observational Study

Coronavirus SARS-CoV-2; COVID-19; 2019-nCoV; Vacunes; EmbaràsCoronavirus SARS-CoV-2; COVID-19; 2019-nCoV; Vacunas; EmbarazoCoronavirus SARS-CoV-2; COVID-19; 2019-nCoV; Vaccines; PregnancyThe COVID-19 pandemic has raised questions about the possible cross immunity resulting from common vaccination programs and SARS-CoV-2 infection. Therefore, the Spanish Obstetric Emergency group performed a multicenter prospective study on the vaccination status of Influenza and Tdap (diphtheria, tetanus and pertussis vaccine boost administered in adulthood) in consecutive cases of SARS-CoV-2 infection in a pregnancy cohort, in order to assess its possible association with the clinical presentation and severity of symptoms of SARS-CoV-2 infection, as well as to determine the factors that may affect vaccination adherence. A total of 1150 SARS-CoV-2 positive pregnant women from 78 Spanish hospitals were analyzed: 183 had not received either vaccine, 23 had been vaccinated for Influenza only, 529 for Tdap only and 415 received both vaccines. No association was observed between the vaccination status and the clinical presentation of SARS-CoV-2 infection and/or the severity of symptoms. However, a lower adherence to the administration of both vaccines was observed in the Latin-American subgroup. Based on the results above, we reinforce the importance of maternal vaccination programs in the actual pandemic. Health education campaigns should be specially targeted to groups less likely to participate in these programs, as well as for a future SARS-CoV-2 vaccination campaign.This research was supported by public funds obtained in competitive calls: Grant COV20/ 00021 from the Instituto de Salud Carlos III-Spanish Ministry of Health, and co-financed with Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) funds

Autopistas salvajes: propuesta de WWF España para una Red Estratégica de Corredores Ecológicos entre espacios Red Natura 2000

La propuesta de corredores realizada en este documento se basa en los resultados del siguiente estudio encargado por WWF España: Estudio para la identificación de redes de conectividad entre espacios forestales de la Red Natura 2000 en España. ETSI Montes, Forestal y del Medio Natural. Universidad Politécnica de Madrid. 2016. Autores: María Cruz Mateo Sánchez, Begoña de la Fuente Martín, Aitor Gastón González y Santiago Saura Martínez de Toda.[ES] Un territorio donde los espacios de valor natural estén conectados y se permita el movimiento de fauna y flora, el intercambio de genes y, en un sentido más amplio, el funcionamiento de procesos ecológicos, es clave para conservar la biodiversidad y los recursos naturales y para afrontar con mayores garantías los efectos indeseables del cambio climático. En España, además, sometida a fuertes procesos de transformación del paisaje y a los efectos del cambio climático, el freno a los procesos de aislamiento y fragmentación de hábitats para las especies y la búsqueda de soluciones para garantizar la conectividad ecológica se convierten en tareas especialmente relevantes para detener la pérdida de biodiversidad. Y es que diversos estudios ya han constatado que no es posible alcanzar los objetivos de conservación basándose únicamente en la declaración de espacios protegidos aislados (Franklin, 1993; Krosby y otros, 2010; Laurance y otros, 2012; Juffe-Bignoli y otros, 2014; Saura y otros, 2018). Esto ha tenido como consecuencia que comience a considerarse, en un número creciente de países, la necesidad de establecer redes de conectividad que faciliten el flujo de organismos y procesos ecológicos entre dichos espacios. A la vista de esto, y de las obligaciones legales derivadas de las legislaciones europea y nacional, WWF presenta en este documento una visión de conectividad para la España peninsular con una propuesta de corredores ecológicos como nexos entre espacios de la Red Natura 2000. Es una identificación que tiene en cuenta los corredores transfronterizos, que funcionan como conectores entre espacios ubicados en territorio español y trascurren en parte de su trazado por territorio de países limítrofes (Portugal, Francia y Andorra). Por motivos metodológicos no se incluyen en el estudio los territorios insulares. Esta propuesta ha sido generada a partir de un estudio realizado por la Universidad Politécnica de Madrid por encargo de WWF España. Se han identificado los corredores prioritarios entre los hábitats forestales de Red Natura 2000 con el objetivo de garantizar la movilidad de las especies forestales. Se ha elegido este enfoque por la amplia representación de este tipo de hábitats en España y en la Red Natura 2000, así como por la mayor disponibilidad de información necesaria para los análisis de conectividad. También se ha determinado qué corredores tienen mayor necesidad de ser restaurados para mejorar la conectividad de la red, cuáles son prioritarios para la conservación, de manera que se mantengan al menos en sus condiciones actuales, y qué tramos de estos corredores están actuando como cuellos de botella, dificultando el movimiento de las especies y con condiciones particularmente frágiles para garantizar su papel conector. Esta propuesta se ha realizado usando las mejores y más recientes herramientas y metodologías disponibles para el análisis de la conectividad (Saura y Pascual-Hortal, 2007; Saura y Torné, 2009; McRae y Kavanagh, 2011; De la Fuente y otros, 2018) y se centra en las necesidades de movimiento de un amplio grupo de especies forestales y en favorecer la conexión para una variedad de hábitat (bosques densos, bosques claros y matorrales) y procesos ecológicos asociados a los mismos. Sin embargo, la propuesta no abarca aspectos como la conectividad para especies y hábitats de tipo más estepario y de ámbito agrario, así como la de hábitats acuáticos. Sin duda, sería de gran interés analizar dichas carencias en el futuro para sumar información al presente estudio. En conclusión, los resultados aportan información geográfica explícita clave para ser tenida en cuenta por políticas ambientales y sectoriales —de planificación territorial, agricultura o transporte— y alcanzar así las obligaciones y compromisos de España respecto a la conservación de la biodiversidad. Autopistas Salvajes. Propuesta de WWF España para una Red Estratégica de Corredores Ecológicos entre espacios Red Natura 2000 aporta una visión necesaria y de futuro que también será muy valiosa para alcanzar la conectividad ecológica entre países europeos.Este trabajo ha sido posible gracias al apoyo de la Fundación MAVA

SARS-CoV-2 Infection and C-Section: A Prospective Observational Study

Pregnant women are particularly vulnerable to the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) pandemic. In addition to unfavorable perinatal outcomes, there has been an increase in obstetric interventions. With this study, we aimed to clarify the reasons, using Robson's classification model, and risk factors for cesarean section (C-section) in SARS-CoV-2-infected mothers and their perinatal results. This was a prospective observational study that was carried out in 79 hospitals (Spanish Obstetric Emergency Group) with a cohort of 1704 SARS-CoV-2 PCR-positive pregnant women that were registered consecutively between 26 February and 5 November 2020. The data from 1248 pregnant women who delivered vaginally (vaginal + operative vaginal) was compared with those from 456 (26.8%) who underwent a C-section. C-section patients were older with higher rates of comorbidities, in vitro fertilization and multiple pregnancies (p < 0.05) compared with women who delivered vaginally. Moreover, C-section risk was associated with the presence of pneumonia (p < 0.001) and 41.1% of C-sections in patients with pneumonia were preterm (Robson's 10th category). However, delivery care was similar between asymptomatic and mild-moderate symptomatic patients (p = 0.228) and their predisposing factors to C-section were the presence of uterine scarring (due to a previous C-section) and the induction of labor or programmed C-section for unspecified obstetric reasons. On the other hand, higher rates of hemorrhagic events, hypertensive disorders and thrombotic events were observed in the C-section group (p < 0.001 for all three outcomes), as well as for ICU admission. These findings suggest that this type of delivery was associated with the mother's clinical conditions that required a rapid and early termination of pregnancy.This project was supported by public funds that were obtained in competitive calls: Grant COV20/00021 (EUR 43,000 from the Instituto de Salud Carlos III-Spanish Ministry of Health) and co-financed with Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) funds

Scattering of 8He on 208Pb at 22 MeV

The skin nucleus 8He is investigated by measuring the angular distribution of the elasticly scattered 8He and the 6,4He fragments produced in the collision with a 208Pb target at 22 MeV, just above the Coulomb barrier. The experiment was carried out at SPIRAL/GANIL in 2010. Here we present preliminary results for the elastic scattering

Pregnancy Outcomes and SARS-CoV-2 Infection: The Spanish Obstetric Emergency Group Study

Pregnant women who are infected with SARS-CoV-2 are at an increased risk of adverse perinatal outcomes. With this study, we aimed to better understand the relationship between maternal infection and perinatal outcomes, especially preterm births, and the underlying medical and interventionist factors. This was a prospective observational study carried out in 78 centers (Spanish Obstetric Emergency Group) with a cohort of 1347 SARS-CoV-2 PCR-positive pregnant women registered consecutively between 26 February and 5 November 2020, and a concurrent sample of PCR-negative mothers. The patients' information was collected from their medical records, and the association of SARS-CoV-2 and perinatal outcomes was evaluated by univariable and multivariate analyses. The data from 1347 SARS-CoV-2-positive pregnancies were compared with those from 1607 SARS-CoV-2-negative pregnancies. Differences were observed between both groups in premature rupture of membranes (15.5% vs. 11.1%, p < 0.001); venous thrombotic events (1.5% vs. 0.2%, p < 0.001); and severe pre-eclampsia incidence (40.6 vs. 15.6%, p = 0.001), which could have been overestimated in the infected cohort due to the shared analytical signs between this hypertensive disorder and COVID-19. In addition, more preterm deliveries were observed in infected patients (11.1% vs. 5.8%, p < 0.001) mainly due to an increase in iatrogenic preterm births. The prematurity in SARS-CoV-2-affected pregnancies results from a predisposition to end the pregnancy because of maternal disease (pneumonia and pre-eclampsia, with or without COVID-19 symptoms)